As diferenças residem nas tecnologias e métodos subjacentes utilizados para comprimir e arquivar ficheiros. O Shell Zip utiliza os comandos do sistema, o ZipArchive é uma classe PHP para a manipulação de ficheiros zip e o DupArchive é um motor personalizado desenvolvido para o plug-in Duplicator Pro, que responde às suas necessidades específicas. A escolha do motor pode afetar factores como a velocidade, a compatibilidade e a funcionalidade no contexto da aplicação que o utiliza.
Diferença entre cada motor de arquivo
Fecho de correr em concha
O Shell Zip utiliza a função PHP shell_exec do PHP para acessar o executável zip do seu servidor e criar o backup em formato zip. Este método é geralmente mais rápido e mais confiável do que usar o PHP ZipArchive. Se esta opção estiver disponível no seu sistema e não encontrar problemas, sugerimos que selecione Shell Zip.
ZipArquivo
ZipArchive é uma classe PHP que permite a manipulação de arquivos Zip. Fornece uma interface de programação para a criação e extração de ficheiros zip diretamente em scripts PHP. O ZipArchive é mais portátil em diferentes configurações de servidor, uma vez que funciona ao nível do PHP, garantindo consistência na criação de ficheiros zip independentemente do sistema operativo subjacente.
DupArquivo
O DupArchive é um formato de ficheiro que gera um ficheiro [archive.daf], exclusivo do Duplicator Pro. Especificamente adaptado ao Duplicator Pro, este formato dá prioridade ao desempenho e à escalabilidade. Os fornecedores de alojamento económico impõem muitas vezes restrições rigorosas de tempo, CPU e I/O nos seus servidores. DupArchive foi concebido para ultrapassar estas limitações, permitindo aos utilizadores criar cópias de segurança maiores sem serem prejudicados por restrições do servidor.
Gerir o ZipArchive
Para criar arquivos, o Duplicator precisa da classe ZipArchive instalada. No entanto, esta não é necessária para a instalação de cópias de segurança. Abaixo estão as instruções para configurar o ZipArchive no seu site, caso ele ainda não esteja instalado.
Pode validar facilmente a instalação do ZipArchive verificando com phpinfo. Estas definições podem ser visualizadas navegando para Duplicator Pro " Ferramentas " Geral " PHPinfo.

Desloque-se para Configurar comando e verifique se a opção -enable-zip está activada:

Perguntas mais frequentes
extension=php_zip.dll
No Mac e no Linux:
extension=zip.so
Manual de PHP | Fóruns XAMPP | Fóruns WampServer | Pesquisa no Google
Recursos para Mac (MAMP):
Manual de PHP | Fóruns MAMP | Artigo 1 | Tópico 1Tópico2
Veja também: Como é que faço uma "extração manual" ou executo o instalador sem o Zip ativado?